В выражении  "Не пищите!" глагол стоит в повелительном наклонении. В таком случае корень будет "пищ" окончание "и", а "те" будет постфиксом, добавляемом в повелительном наклонении. Постфикс выделяется так же, как и суффикс.
В выражении "Зачем вы пищите?" глагол "пищите" стоит в привычном нам изъявительном наклонении. В данном случае корень снова будет "пищ", а "ите - окончание, характерное, второму лицу, множественному числу.

1. пищ=корень и-суффикс те=окончани глагола 2 лица повелительного наклонения.   2. пищ=корень   ите=окончание глагола 2лица  изъявительного наклонения настоящего времени